BPR實施的過程，主要包括成立流程重組項目組、流程的識別與流程圖的繪制、企業流程的分析、流程關鍵點的處置、創意思考、實施運轉。BPR項目的實施工作主要包括：業務方案的提出、教育培訓、項目管理和質量控制三個層次。從項目進行的時間順序來看，BPR項目可分為項目準備、評估與診斷、業務重組、實施轉換和系統規劃五個階段。

在BPR實施過程中需要注意的問題：第一、取得高層領導的參與和支持。第二、選擇適當的流程進行重組。第三、建立通暢的溝通渠道。第四、利用信息技術手段協調分散與集中的矛盾。

其中，取得高層領導持續性的參與和明確的支持，能明顯提高BPR成功的概率。因為BPR是一項跨功能、跨部門的工程，是改變企業模式和人的思維方式的變革，必然對員工和他們的工作產生較大影響。特別是BPR常常伴隨著權力和利益的轉移，有時會引起一些人，尤其是中層領導的抵制。因此，如果沒有高層管理者的明確支持，BPR將很難推行。

與BPR無縫結合的ERP

在BPR實施成功的案例中，有很多都與企業信息化的實施分不開的。可以說，在BPR從思想到現實的轉變中，信息化作為一個重要手段起到了一種催化劑的作用。當前BPR的實施主要是與ERP結合在一起。

BPR側重企業業務過程的整體最優化，ERP側重在合理的業務過程基礎上，實現對企業資源的有效利用與管理，為了實現兩者的目標，BPR和ERP幾乎是互為條件，與此同時在過程管理與資源管理方面又互為補充。因此，BPR的實施與ERP系統的應用能顯著地改善現代企業管理的效率，兩者結合是比較有效的。

惠普咨詢主張將BPR過程和ERP軟件的選擇、實施過程進行整體考慮，而后分步實施。在BPR設計未來流程的階段，即考慮到所提出的重組方案是否具有可操作性，是否有ERP軟件可以支持，以及使用ERP軟件中的何種功能實現等。

而ERP軟件的實施，又是在前期BPR的結果指導下進行的，是在優化與重組后的流程基礎上進行的軟件實施。因此BPR與ERP項目是相輔相成，無縫銜接的。這樣，既能保證企業的重組戰略因有信息系統的支持而具有可操作性，又使ERP軟件的運行結果是將其蘊含的管理思想真正傳遞到用戶的業務中。

根據BPR階段實施成果--經過優化與重組的業務流程，以及建立的實施模型和工作路線圖，企業ERP項目的實施主線主要是：戰略→業務流程優化設計→ERP系統配置及其它應用系統集成設計與開發，這是整個企業ERP實施的主線。