風險六:長期投資大，難以收尾。自主開發的先期投資會比購買商品化軟件低，但從長遠來看，由于需要高薪維持一支強大的開發和維護隊伍，其實際投資要比購買現成軟件系統大得多。
風險七:阻礙企業管理變革。由于系統完全根據現狀定制，缺乏足夠的靈活性，一旦企業內部進行深化改革，系統可能無法滿足需要。
但是，如果企業選擇購買商品化軟件，就會遇到選型的問題，同樣會存在風險，具體歸納如下。
風險一:系統功能不能滿足企業管理流程需要。
風險二:軟件系統的規模和可擴展性與企業的現狀和未來的增長及發展戰略產生矛盾。
風險三:軟件供應商缺乏足夠的服務支持，并且一旦其退出市場，用戶會失去系統維護和升級方面的支持。
風險四:軟件系統的規模過大，造成實施難度大、周期長，甚至失敗。
風險五:軟件供應商缺乏自身或合作伙伴的實施支持能力。
風險六:軟件系統過于復雜，用戶員工的計算機應用素質較低，難以實現知識轉移。
風險七:系統的技術支持和復雜程度使用戶難于發現和保留專門人才對系統進行后續支持和開發。
風險八:一次性投入過于龐大，企業難以承受。
　　2.實施過程中的風險

由于不同行業、不同企業千差萬別，這個過程中的風險也會各有不同。根據我們的經驗，大體上來說在系統的實施過程中的風險具有以下通性。
風險一:如果用戶決定自行實施ERP系統，是否具備足夠的技術力量、項目管理和控制的能力以及有效的實施方法相當關鍵。
風險二:如果用戶決定雇傭顧問公司幫助實施，需要重點考察其是否具備足夠的水平和經驗。
風險三:在實施過程中難免會遇到企業管理流程和機構重組問題，由于牽涉到企業各部門的利益和運作習慣，相關人員的觀念難以轉變，部門之間難以協調，中層領導出現阻力，缺乏改革的動力。
風險四:企業實施ERP系統的目標不明確，實施范圍不確定，并且在實施過程中經常發生變化，導致實施困難。
風險五:實施過程中需要企業項目實施小組成員全力的投入。但因為業務繁忙、時間沖突，造成項目人力資源方面的矛盾。
風險六:項目管理能力不足，溝通不夠，造成項目實施過程中的混亂。
風險七:決策層缺乏充分投入，關鍵問題長期懸而未決。
風險八:由于選型不當，造成實施過程中業務流程和管理的需求在系統中難以實現。
風險九:企業用戶缺乏足夠的技術支持。
風險十:實施的時間不充分。
風險十一:系統過于復雜導致操作人員難以掌握系統，或者操作人員的培訓不夠充分。
風險十二:企業的業務方向在實施過程中發生改變，或者市場環境發生變化。
風險十三:投入高，但預期的目標和效果難以達到。
風險十四:流程的重組、系統的實施給企業帶來的變化使企業難以適應，從而造成管理上的混亂。
風險十五:如果企業用戶在實施新的系統之前正在使用一套舊的系統，新系統的啟動會造成歷史數據與新系統無法兼容。